Devlet Gümrük Komitesi Akademisi'nin ilk yüksek lisans öğrencileri 2020/2021 eğitim öğretim yılında mezun olacak. Böylece dünya ekonomisi alanında dört yüksek lisans "Gümrük" alanında, iki yüksek lisans ise hukuk alanında "Uluslararası hukuk" alanında derece ile mezun olmaktadır.

Akademi'de yüksek lisans programına kabul ilk kez 2019/2020 eğitim öğretim yılında yapıldı. Akademi'de yüksek lisans öğrencilerinin kaliteli eğitim almaları için uygun koşullar oluşturulmuştur.

2021/2022 akademik yılında, dünya ekonomisi alanında "Gümrük", hukuk alanında "Uluslararası ekonomik hukuk" uzmanlık alanında yüksek lisansa kabulün planlandığı belirtilmelidir.